Klimat
Havets hotade arter kartläggs med ny metod
Enligt Artdatabankens rödlista är nära var femte art hotad. Men hur det ser ut för ryggradslösa djur i havet – där arternas habitat förändras snabbt – är i många fall oklart. Med en ny dna-metod ska forskare nu kartlägga de anonyma ryggradslösa djuren.
Prenumerera på Extrakts nyhetsbrev!
Läs mer
Håll dig uppdaterad! Få kunskapen, idéerna och de nya lösningarna för ett hållbart samhälle.
Personuppgifter lagras endast för utskick av Extrakts nyhetsbrev och information kopplat till Extrakts verksamhet. Du kan när som helst säga upp nyhetsbrevet, vilket innebär att du inte längre kommer att få några utskick från oss
Världens djurbestånd har minskat kraftigt de senaste 40 åren, enligt WWF:s rapport Living Planet från oktober 2018. I den konstateras att populationerna av ryggradsdjur har minskat med 60 procent sedan 1970.
I Sverige visar den senaste rödlistan från 2015 att antalet hotade arter ökat med 3,6 procent sedan 2010. Omkring 4 300 arter ryms på listan, och ett område sticker ut: av de rödlistade arter som återfinns i havet kategoriseras 53 procent under rubriken kunskapsbrist.
– Vi har kommit långt i Sverige och bedömer många arter jämfört med andra länder. Men de flesta arter som har rödlistats är däggdjur, kräldjur, groddjur och växter. Vad gäller evertebrater, ryggradslösa djur, ligger vi efter, säger Sonja Leidenberger.
En mikroliter kan räcka
Hon är doktor i marinbiologi och ansvarig för ett nytt forskningsprojekt vid Högskolan i Skövde, med målet att ta fram bättre metoder för att hitta hotade evertebrater. De metoder som i dag används i marina miljöer och i insjöar är ofta kostsamma och inte alltid effektiva, till exempel dykning, trålning och filmning.
– Enligt traditionella metoder samlar man in, sorterar och slutligen artbestämmer med hjälp av lupp och mikroskop. Vi ska testa en metod med e-dna, environmental dna eller miljö-dna. Då kan det räcka med några mikroliter. Med hjälp av en artspecifik primer ser vi om dna från en viss art eller en hel grupp arter finns där, säger hon.
En förutsättning är att det finns en referensdatabank att jämföra mot, och i Sverige har man genom ett antal olika forskningsprojekt kommit ganska långt i arbetet med att kartlägga arternas CO1-gen, som man gemensamt har bestämt sig för att utgå från.
Utanför Sverige används metoden ganska ofta på terrestra djur, säger Sonja Leidenberger, men mer sällan i marina miljöer.
– Vi testade att använda e-dna när vi tittade efter invasiva arter för ett par år sedan. I samband med det projektet hittade vi den mycket sällsynta sågtångsräkan i ett prov från Västkusten.
Nära Smögen
Sågtångsräkan lever på över 50 meters djup och är en av de arter som det enligt Artdatabanken råder kunskapsbrist om.
– Vi hittade den vid Hållö nära Smögen och i Gullmarsfjorden. Den är extremt svår att hitta med traditionella metoder. Nästa steg, när vi nu har upptäckt arten med hjälp av e-dna, är att ute i fält ta reda på hur stor populationen är. Än så länge kan vi inte bestämma hur många individer det handlar om med hjälp av e-dna, säger Sonja Leidenberger.
En fördel med e-dna som miljöövervakningsmetod är att den fungerar även på platser där det är svårt att inventera på traditionellt vis, exempelvis på djupt vatten.
– På Artdatabanken funderar man över hur man kan använda e-dna i rödlistningsprocessen. Vi kommer tyvärr inte hinna klart till nästa rödlistning som kommer 2020, men vi hoppas kunna testa metoden i samband med Helcoms rödlista, en rödlista specifikt för Östersjöns arter, säger Sonja Leidenberger, som också har en bakgrund som konsulent på Artdatabanken.
”Ett fönster att agera”
Sonja Leidenberger har tidigare forskat kring isopoder, havsgråsuggor, och slogs då av hur lite forskningen vet om kräftdjur utöver de kommersiellt intressanta arterna.
I prover från både Västkusten och runtom i Östersjön hittade hon bara några få av de arter som fanns beskrivna i 20 år gammal litteratur.
– Det var skrämmande. Det händer mycket i den marina miljön. Kustnära områden blir allt varmare, i våras gick havstemperaturen upp rekordsnabbt och sommaren blev rekordvarm. Sjögräsängar som försvinner påverkar kräftdjur i stor utsträckning, liksom exploatering och utsläpp.
– Vi har ett kort fönster nu när vi kan agera – då blir det också viktigt med effektiva metoder så att vi snabbare kan upptäcka de populationer som vi inte vet hur de mår.
Inventering med hjälp av e-dna
• Environmental dna, e-dna, är en metod som drar nytta av det faktum att alla djur lämnar ifrån sig dna i naturen genom spillning, hudavlagringar och annat. Djurens dna finns kvar i vattnet i ungefär två veckor.
• Vattenprov som samlas in ute i fält analyseras sedan i laboratorium. Där extraherar man dna från de celler som finns i provet.
• Med den artspecifika ddPCR-metoden (droplet digital Polymerase Chain Reaction) kopieras korta dna-fragment med hjälp av markörer för artspecifika dna-sekvenser. Det gör att metoden fungerar även med små mängder dna.
• I en populärvetenskaplig rapport från Sveriges lantbruksuniversitet beskrivs provtagning av e-dna från fisk, kräftor och musslor.
• Flera forskningsprojekt har nyligen fått medel för att titta närmare på hur dna-metoder kan användas inom miljöövervakning. Bland annat har åtta projekt beviljats medel av Naturvårdsverket. Här kan du läsa om ett av dem, om provtagningsmetoder för vattenmiljöer.
• Projektet vid högskolan i Skövde startar i mars 2019 och pågår i drygt tre år i samarbete med Zoological Research Museum Alexander Koenig i Bonn, Tyskland.
Fakta: SLU (Sveriges lantbruksuniversitet), SVA (Statens veterinärmedicinska anstalt), Naturhistoriska riksmuseet, Naturvårdsverket
Evertebrater
• Evertebrater är ett samlingsnamn för alla ryggradslösa djur. De brukar delas upp i limniska evertebrater, som lever i sötvatten, och marina, som lever i havet.
• De marina evertebrater som hittills har bedömts i Artdatabankens rödlista är tagghudingar (sjöborrar, sjögurkor, sjöstjärnor med mera), armfotingar, koralldjur, manteldjur, kräftdjur, havsborstmaskar samt blötdjur (musslor, mollusker, bläckfiskar, snäckor med mera).
• Av de 611 arter av marina evertebraterna som bedömdes till den senaste rödlistan klassificerades 226 arter som hotade i olika grad.
• Mer än hälften av arterna fanns det för lite kunskap om för att de skulle kunna placeras i någon hotkategori, i stället klassas de som ”kunskapsbrist”.
• Limniska evertebrater, som lever i sötvatten, är till exempel musslor, insekter och deras larver, djurplankton. Omkring 200 av de limniska evertebraterna finns med på rödlistan.
Fakta: Artdatabanken